Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B6

TCRBV3S1, T-cell receptor beta variable 28 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV3S1A0A5B6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCRBV3S1A0A5B6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCRBV3S1A0A5B6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCRBV3S1A0A5B6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCRBV3S1A0A5B6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCRBV3S1A0A5B6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCRBV3S1A0A5B6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TCRBV3S1A0A5B6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCRBV3S1A0A5B6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCRBV3S1A0A5B6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCRBV3S1A0A5B6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCRBV3S1A0A5B6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCRBV3S1A0A5B6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCRBV3S1A0A5B6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCRBV3S1A0A5B6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCRBV3S1A0A5B6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCRBV3S1A0A5B6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCRBV3S1A0A5B6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCRBV3S1A0A5B6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCRBV3S1A0A5B6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCRBV3S1A0A5B6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCRBV3S1A0A5B6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCRBV3S1A0A5B6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCRBV3S1A0A5B6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCRBV3S1A0A5B6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCRBV3S1A0A5B6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TCRBV3S1A0A5B6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV3S1A0A5B6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV3S1A0A5B6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV3S1A0A5B6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCRBV3S1A0A5B6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCRBV3S1A0A5B6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV3S1A0A5B6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV3S1A0A5B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV3S1A0A5B6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV3S1A0A5B6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCRBV3S1A0A5B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCRBV3S1A0A5B6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCRBV3S1A0A5B6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms