Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1-27A0A075B6S5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV1-27A0A075B6S5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGKV1-27A0A075B6S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV1-27A0A075B6S5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV1-27A0A075B6S5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1-27A0A075B6S5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV1-27A0A075B6S5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1-27A0A075B6S5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1-27A0A075B6S5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1-27A0A075B6S5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1-27A0A075B6S5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1-27A0A075B6S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV1-27A0A075B6S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV1-27A0A075B6S5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1-27A0A075B6S5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGKV1-27A0A075B6S5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1-27A0A075B6S5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV1-27A0A075B6S5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGKV1-27A0A075B6S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms