Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF1Q9H7N4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF1Q9H7N4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms