Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTP4Q96DX8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTP4Q96DX8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms