Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms