Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6CQ53S08 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms