Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms