Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT16Q17RD7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT16Q17RD7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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