Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8Q15843 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8Q15843 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8Q15843 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8Q15843 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8Q15843 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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