Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TUBB3Q13509 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TUBB3Q13509 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TUBB3Q13509 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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