Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms