Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms