Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD63C9JTQ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms