Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM149AA5PLN7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms