Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms