Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TNPO3Q9Y5L0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TNPO3Q9Y5L0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms