Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms