Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms