Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms