Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms