Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms