Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPROQ16827 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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