Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms