Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms