Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPB2P35606 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms