Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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