Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD1BQ9P298 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms