Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SSBP4Q9BWG4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms