Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms