Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms