Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms