Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms