Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms