Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRTM2O43300 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRTM2O43300 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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