Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms