Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms