Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms