Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP4Q96EB1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms