Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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