Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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