Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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