Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAP2Q03519 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms