Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms