Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA8P53708 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA8P53708 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms