Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNSO60931 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNSO60931 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms