Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVH48-1M5A8F1 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms