Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms