Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMTM6Q9NX76 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms