Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms