Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRT10P13645 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRT10P13645 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT10P13645 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms